1. 显微镜是精密仪器，使用时必须按照操作规程，做到细心和耐心，切勿操之过急、动作过猛，以防操作失误而损坏构件 。
2. 不要用手触摸光学玻璃部分，同时防止剧烈碰撞而损坏构件。
3. 观察时一定要加盖玻片，不能让玻片上的水流到移动台上，更不能让酸、碱及其他化学药品接触显微镜，不能让显微镜在阳光下曝晒。
4. 使用细准焦旋钮时，如遇到不能继续向同一方向转动而到达极限时，不能蛮拧，应向相反方向退转，并转动粗准焦旋钮，然后再用细准焦旋钮进行细调。
5. 目镜或物镜如有不洁时，要用专门的镜纸作直线方向揩拭，切勿用手指或手帕及棉布涂擦。目镜或物镜如沾有油污，可先用专门的镜纸沾少许二甲苯（或无水乙醇和乙醚1∶1）擦拭干净，再用干净擦镜纸揩拭一遍。